Тёмное собрание

После того как Тайё Асано потерял родных в автокатастрофе, он стал бояться сближаться с другими людьми. Парень замкнулся в себе и отказывался гулять с друзьями, отклоняя приглашения в кафе, караоке или на прогулку. Только с Муцуми Ёдзакурой, подругой детства, которая поклялась всегда быть рядом, Тайё чувствовал себя спокойно.

С детства отец воспитывал Клэй в духе независимого исследователя. Девочка послушно тренировалась, превосходно усвоила его науку и, как и он, овладела профессией вора, в чём-то даже превзойдя отца. Однако три года назад её отец бесследно пропал в подземелье, и с тех пор Клэй настойчиво изучает это подземелье, чтобы узнать, что всё-таки случилось с отцом.

Мир Терры постоянно разрушается Катастрофами, вынуждая его жителей постоянно переселяться. Катастрофы принесли с собой пандемию: возникло смертельное заболевание Орипатия, вызванное воздействием Оргиниума, особого минерала, остающегося после Катастроф. Из-за стопроцентной смертности и высокой заразности болезни враждебность по отношению к инфицированным стала распространённым явлением, что привело к их массовому карантину и изгнанию правительствами всего мира, а также к возникновению напряжённости между инфицированными и неинфицированными жителями. Однако Оргиниум также используется как источник энергии и материал для строительства, а ещё является источником магических способностей. Игрок берёт на себя роль страдающего амнезией Доктора, который командует «операторами» фармацевтической, медицинской и оборонительной организации «Остров Родос». По мере распространения Орипатии «операторы» лечат инфицированных и защищаются от Движения Воссоединения, негосударственной военной организации заражённых, цель которой отомстить правительствам Терры за преследование жертв Орипатии.

В пятилетнем возрасте юный Герцог был проклят ведьмой, и теперь всё живое, к чему он прикоснётся, сразу погибает. Чтобы обезопасить окружающих, мальчика сослали в старую резиденцию посреди леса, и он был вынужден проводить дни в изоляции от людей. Казалось, весь мир позабыл о существовании маленького аристократа, пока тот страдал от одиночества и отчаяния.